שלב שני:
ציטוטים בגוף העבודה וכתיבת רשימה ביבליוגרפית.
לאחר שהכנסנו את הפריטים בהם נשתמש
בכתיבת העבודה ל-Mendeley,
אפשר להתחיל לצטט אותם (בגוף העבודה)
וליצור רשימה ביבליוגרפית (בסוף העבודה).
זאת אנו עושים ב-MS Word באמצעות התוסף של Mendeley
כיצד להכניס ציטוטים בגוף העבודה 
לאחר שסיימנו את הכתיבה ניתן ליצור רשימה ביבליוגרפית בסופה
מלבד היותו כלי לניהול מקורות וציטוטים, Mendeley מאפשר לנו גם לעבוד על קבצי PDF של מאמרים.
אנו יכולים למרקר, להוסיף הערות ועוד (אך לא להעתיק קטעים, מכיון שאלו קבצי PDF).
שלב ראשון: איתור מאמרים /ספרים/סוגי מקורות אחרים: לאחר שאיתרנו את אלו עלינו להעבירם לכלי לניהול מקורות וציטוטים, כדי שנוכל אחר כך להשתמש בהם.
יש מספר דרכים לשמור ציטוטים ב Mendeley:
א. יצוא ישיר
ממאגרי מידע ספציפיים
קטלוג הפריטים של כלל משתמשי Mendeley - ראה תיבה נפרדת
ב. לכידה
מאגרי מידע
Google Scholar
רשומות מאמרים בכתבי עת
קטלוגים שונים
גרירה ושחרור קובץ PDF לספרייה האישית ב- Mendeley
ד. יצוא עקיף
ממאגרי מידע או תוכנות אחרות לניהול ציטוטים
ייבוא קבצים שנשמרו כ- XML, BibTex או RIS
ה. באופן ידני 
פתיחת רשומת פריט שלא נמצא במאגר/קטלוג – דפי אינטרנט, דו"חות וכו'
Mendeley הוא כלי חינמי לניהול מקורות וציטוטים, ורשת חברתית אקדמית עם ממשקי אינטרנט, שולחן עבודה ומכשירים ניידים, שניתן לסנכרן ביניהם.
חשבון חינמי מקנה נפח אחסון של GB2 ומגביל את מספר הקבוצות שניתן לשתף. ניתן לשדרג לחשבון פרימיום.
Mendeley מאפשר לנו:
א. לשתף מקורות, הערות ותובנות עם אחרים באמצעות קבוצות Mendeley
ב. מגוון אפשרויות של הרשאות, פרטיות ועריכה
ג. יצירת קשר עם חברים אחרים בקבוצה בדף הקבוצה.
